Distribusi Infeksi "Mycobacterium tuberculosis" Ekstra Paru dengan Diagnosis in-house RT-PCR di Laboratorium Mikrobiologi Klinik Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia Tahun 2020 – 2021
Kata Kunci:
Tuberkulosis, Ekstra Paru, in-house RT-PCRAbstrak
Indonesia adalah negara dengan dengan beban tuberkulosis (TBC) tertinggi kedua di dunia dengan insidensi mencapai 969 ribu kasus di tahun 2022. Tuberkulosis disebabkan oleh infeksi kuman Mycobacterium tuberculosis (Mtb) yang situs infeksi utamanya adalah saluran pernapasan, namun dapat pula menginfeksi organ atau sistem tubuh lainnya yang dikenal sebagai TB ekstra paru (TBEP). Pada studi ini, dilakukan analisis distribusi TBEP positif dengan diagnosis molekuler (in-house real-time polymerase chain reaction (RT-PCR)) di Laboratorium Mikrobiologi Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia (LMK FKUI) pada tahun 2020-2021. Penelitian ini termasuk penelitian observasional deskriptif dengan metode studi potong lintang. Pengambilan sampel dilakukan secara purposive sampling dari data rekam medis TBEP dengan permintaan pemeriksaan TB secara in-house RT-PCR. Pada tahun 2020 terdapat 108 sampel, 33 di antaranya menunjukkan hasil positif Mtb (30,56%). Sementara di tahun 2021, terdapat 593 sampel, dengan 42 di antaranya positif Mtb (7,08%). Dari 75 sampel TBEP positif, sampel jaringan dan liquor cerebrospinal (LCS) adalah 2 jenis sampel dengan hasil TBEP positif tertinggi berturut-turut pada tahun 2020 dan 2021. Sementara itu, hanya 19 data yang memiliki informasi jenis kelamin dengan persentase perempuan 52,63% dan laki-laki 47,37%, serta hanya 48 data yang memiliki informasi usia pasien tertinggi adalah 72 tahun dan terendah adalah 11 bulan. Terdapat peningkatan jumlah permintaan pemeriksaan TBEP, namun terjadi penurunan persentase TBEP positif di LMK FKUI dari tahun 2020 ke 2021 dengan lokasi infeksi terbanyak yaitu jaringan dan LCS.
Unduhan
Referensi
WHO. Global Tuberculosis Report 2022. [Internet]. 2023 [cited 2023 Oct 12]. Available from: https://www.who.int/teams/global-tuberculosis-programme/tb-reports
KEMENKES Republik Indonesia. Dashboard TB [Internet]. TBC Indonesia. 2022 [cited 2022 Dec 9]. Available from: https://tbindonesia.or.id/pustaka-tbc/dashboard-tb/
Mashabela GT, de Wet TJ, Warner DF. Mycobacterium tuberculosis Metabolism. Microbiology Spectrum. 2019;7(4):1–14. https://www.google.com/search?q=httpsed://journals.asm.org/doi/10.1128/microbiolspec.GPP3-0067-2018
Delogu G, Sali M, Fadda G. The Biology of Mycobacterium Tuberculosis Infection. Mediterranean Journal of Hematology and Infectious Disease. 2013;:1–5. https://www.google.com/search?q=https://doi.org/10.4084/mjhid.2013.070
Baykan AH, Sayiner HS, Aydin E, Koc M, Inan I, Erturk SM. Extrapulmonary tuberculosıs: An old but resurgent problem. Insights into Imaging. 2022;13(1). https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC9106596/
CDC. Chapter 2: Transmission and Pathogenesis of Tuberculosis. Self-Study Modules on Tuberculosis. 2019;:3–11.
Gill CM, Dolan L, Piggott LM, McLaughlin AM. New Developments in Tuberculosis Diagnosis and Treatment. Breathe. 2022;18(1):210149.
Long R, Divangahi M, Schwartzman K. Chapter 2: Transmission and Pathogenesis of Tuberculosis. Canadian Journal of Respiratory, Critical Care, and Sleep Medicine. 2022;6(sup1):22–32. https://www.google.com/search?q=https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/24745332.2021.2012170
Nachiappan AC, Rahbar K, Shi X, Guy ES, Mortani Barbosa EJ, Shroff GS, et al. Pulmonary Tuberculosis: Role Of Radiology In Diagnosis And Management. RadioGraphics. 2017;37(1):52–72.
Davies PDO, Gordon SB, Davies G, editors. Section III: Diagnosis. In: Clinical Tuberculosis. 5th ed. Boca Raton, Florida: CRC Press; 2014. p. 95–117. https://www.google.com/search?q=https://www.routledge.com/Clinical-Tuberculosis/Davies-Gordon-Davies/p/book/9781444135520
KEMENKES RI. Petunjuk Teknis Pemeriksaan TB dengan Tes Cepat Molekuler. Jakarta, Indonesia: Kementrian Kesehatan Republik Indonesia; 2017.
Nurwidya F, Handayani D, Burhan E, & Yunus F. Molecular Diagnosis of Tuberculosis. Chonnam medical journal. 2018; 54(1): 1–9. https://www.google.com/search?q=https://www.cmj.ac.kr/journal/view.php%3Fdoi%3D10.4068/cmj.2018.54.1.1
Babafemi EO, Cherian BP, Banting L, Mills GA, Ngianga K. Effectiveness Of Real-Time Polymerase Chain Reaction Assay For The Detection of Mycobacterium Tuberculosis in Pathological Samples: A Systematic Review And Meta-Analysis. Systematic Reviews. 2017;6(1).
https://www.google.com/search?q=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5648439/
Jawed A, Tharwani ZA, Siddiqui A, Masood W, Qamar K, Islam Z, et al. Better understanding extrapulmonary tuberculosis: A scopingreview of public health impact in Pakistan, Afghanistan,India, and Bangladesh. Health Sci. Rep. 2023;6:e1357. doi.org/10.1002/hsr2.1357
Chakinala RC, Khatri AM. Gastrointestinal Tuberculosis. [Updated 2023 May 1]. In: StatPearls [Internet]. Treasure Island (FL): StatPearls Publishing; 2023 Jan-. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK556115/
Malik S, Sharma K, Vaiphei K, Dhaka N, Berry N, Gupta P, et al. Multiplex polymerase chain reaction for diagnosis of gastrointestinal tuberculosis. JGH Open. 2018;3(1):32–7. doi:10.1002/jgh3.12100
Donovan J, Thwaites GE, Huynh J. Tuberculous meningitis. Current Opinion in Infectious Diseases. 2020;33(3):259–66. doi:10.1097/qco.0000000000000648
Leonard JM. Central nervous system tuberculosis. Microbiology Spectrum. 2017;5(2). doi:10.1128/microbiolspec.tnmi7-0044-2017